（一）办公室

　　主要职能：协助局领导协调处理日常工作；负责文秘、信息、会务、外事、档案、信访、保密、督察、机关保卫等工作；负责起草综合性文件、报告；检查监督机关内部规章制度的实施；管理机关行政后勤财务；负责局机关离退休人员管理工作。

（二）畜牧处

　　主要职能：研究拟定畜牧业生产发展规划、政策和措施，提出拟定“菜篮子”工程的有关项目计划；指导畜牧业产加销一体化和服务体系建设；收集分析有关畜牧业产供销信息，研究产销动态；管理种畜（禽）场、畜牧业商品基地和其他畜牧业建设项目；编制畜牧业生产技术规范。

（三）兽医处

　　主要职能：负责兽医医政、兽药药政和动物防疫、检疫的监督管理工作；拟定动物疫病防治计划，组织实施重大动物疫病的预防、控制和扑灭工作；拟定兽医、兽药、动物防疫方面的规章制度；审批动物防疫和兽药监督员；负责动物防疫条件的审核及发证工作；负责执业兽医师的考试、注册以及兽医诊疗机构的审批和管理工作；拟定兽药地方标准、兽医卫生技术规范；负责兽药生产、经营企业以及兽药产品、兽药广告的审批、审核和发证工作；负责核发进口兽药许可证和出口兽药的出证工作；负责处理、仲裁兽药生产、经营、使用中的质量事故和纠纷；负责兽药打假和兽药残留监控工作；提出兽医、兽药方面的基础设施建设项目发展计划；负责市控制重大动物疫病指挥部办公室日常事务工作；

（四）政策法规处

　　主要职能：研究拟定发展畜牧兽医事业的方针政策；组织起草畜牧兽医方面的地方性法规、行政规章草案；监督检查畜牧兽医方面的法律、法规、规章的实施；负责对畜牧兽医方面规范性文件的审核、修订和备案；组织对区县畜牧兽医管理部门行政案件的复议工作；负责局系统行政处罚案件的统计、上报工作；管理本系统的行政执法人员；负责局系统行政执法责任制工作；承担局部分综合报告的起草工作。

（五）科教处

　　主要职能：研究制定畜牧业科技工作规划、计划，组织重大科技课题攻关、技术开发、示范推广，负责科技成果管理；组织制定本市行业主产品质量标准、技术标准，监督国家和地方行业标准的实施；组织协调全局涉外经济技术合作与交流工作；管理畜牧系统成人教育、专业技术人员继续教育；负责从事畜牧业农民的技术教育和证书发放工作；负责市畜牧兽医学会的日常工作。

（六）计划财务处

　　计划财务处主要职能：负责编制全市畜牧生产年度计划和中长期规划；按照有关规定审核、申报本市农业区县及局属单位中央和地方两级基建项目，监督项目的执行；负责局系统行政事业费和专项经费的管理工作；会审汇编全市畜牧事业经费、种畜禽场以及局属企业年度会计决算；研究提出利用外资计划；负责畜牧及基建统计工作；负责局属各单位国有资产等管理工作。

　　审计处主要职能：指导局系统内部审计工作；负责对违反财经纪律的检查审计、企业厂长（经理）的离任审计、专项投资拨款使用的调查审计；监督国有资产运行。

（七）企业处

　　主要职能：指导局直属企业的安全生产、劳动工资、物价、标准计量、产品质量等工作；负责三资企业综合统计和对外经济贸易统计工作；检查指导全局安全保卫工作，负责全局社会治安综合治理工作。

（八）组织处

　　主要职能：负责局直属单位领导班子建设和干部任免考察、培训工作。负责基层党组织建设、党员队伍建设、培训教育等工作；负责人事劳资、机构编制、知识分子工作、专业技术人员职称评聘、畜牧兽医行业职业技能鉴定、国外智力引进等工作；负责审核办理出国团组、出国人员政审工作；负责全局离退休干部管理工作。

（九）宣传处

　　主要职能：负责局系统政治理论学习和思想政治工作；负责局及局属单位精神文明创建工作；与有关部门配合，负责全局职工素质教育工作；负责局系统统战工作；负责全市畜牧兽医方面的宣传报道工作，负责我市重大动物疫情等突发事件的对外新闻发布等工作。